微量RNA测序

目前，常规高通量测序建库对样品量的要求较高，许多来源稀少的细胞样品、exosome样品、肿瘤等临床样品以及一些提取困难、容易降解的特殊样品等由于难以获得足量的核酸而无法进行常规建库测序。吉赛生物在丰富的核酸抽提经验的基础上，结合领先的文库构建策略，同时推出微量RNA（＜10ng）测序，为客户提供更全面的测序服务和更专业的数据分析报告。

技术路线

样本要求

• 样品类型：微量RNA样品

• 物种：人、大小鼠（特殊物种详询技术支持）

•具体样品量要求及样本采集、保存和运输方法请参照附录一。

测序方案

测序模式 PE150

测序数据量 10Gb

生物信息分析内容

基础分析  

1 原始数据质控检查

2 比对结果质控检查

3 基于基因表达的样品主成分分析

4 差异基因表达及相关通路富集分析

5 circRNA预测及鉴定

6 circRNA差异分析

7 差异circRNA宿主基因的通路富集分析

8 差异circRNA的靶向miRNA预测分析

9 长链非编码RNA差异分析

高级分析 

10 基于基因表达的通路活性分析  

11 转录调控活性分析及通路互作分析

12 差异长链非编码RNA的调控基因的通路富集分析

13 circRNA及靶向miRNA网络调控制图


高通量测序附录