全基因组SSR鉴定

产品介绍

微卫星标记（SSR）是动植物遗传学研究中一类信息Z丰富、用途Z广泛的DNA标记类型，具有重现性、多等位性、共显性和较高的基因组覆盖率等优点。和双等位基因标记（如SNP）相比，SSR能够提供更多的种群遗传信息。但是传统的标记开发不仅困难同时费用也比较高（EST-SSR，数量少且多态率低）。结合NGS的全基因组测序技术能实现在一个物种全基因组范围内开发大量的SSR标记的目标。SSR标记在物种间的比较、核型分析以及基因组进化方面的研究都有很大的优势。

技术路线

数据要求

1.全基因组SSR鉴定分析,需提供该物质参考基因组；

2.近缘物种间核型分析,需提供FISH实验；

3.群体结构和遗传多样性,需提供该物种自然群体的部分SSR基因型。

 

项目提供服务

 

1.SSR一系列生信分析；

2.SSR标记引物设计，挑选及群体PCR扩增，跑胶。

 

分析内容