真核转录组测序

产品简介：

主要针对转录产物mRNA进行高通量测序，可全面快速获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的基因表达量及结构变异等，可用于差异表达分析、挖掘功能基因、RNA编辑分析等。目前已广泛应用于生物学研究、农业、医学等多个领域，揭示生物生长发育调控机制、不同环境适应机制、作物优良形成机理、疾病发SF展的分子机理等。 

应用领域：

•样本全转录本信息获取

•基因注释及筛选

•基因结构分析

产品优势：

•精确的数字化信号，GX的检测通量，广泛的检测范围 

•富涵7大功能注释数据库，全面精确描述基因功能 

•建立差异表达分析，有效挖掘功能基因 

•专业的定制化信息分析服务 
 

技术路线：

分析内容：

1.测序数据及其质量控制

2.转录组测序数据组装

3.转录组文库质量评估

4. Unigene功能注释

5.基因结构分析：CDS预测、SSR分析、SNP分析

6.基因表达量分析：Unigene表达量计算、不同样品总体表达量比对

7.差异表达分析： 重复相关性评估、差异表达基因筛选、差异表达基因聚类分析

8.差异表达基因功能注释和富集分析：差异表达基因GO功能富集、差异表达基因COG分类、差异表达基因KEGG注释、差异表达基因KEGG通路富集分析

研究路线：

样品要求：

1.样品类型：总RNA；

2.样品浓度：≥250 ng/ul；

3.样品总量：>6ug(真核生物)；>10ug（原核生物）

4.样品纯度： OD260/280为1.8~2.2，OD260/230≥1.0，260nm处有正常峰值。

5.RNA完整性： 电泳检测28S/18S≥1.5。（距送样日最近的电泳结果）