原核转录组测序

产品简介：

原核转录组测序是基于HiSeq平台，构建链特异性文库，研究原核生物在某个时期或者在某种环境条件下转录出来的所有mRNA。由于原核生物mRNA没有polyA尾结构，需要采用去除rRNA的方法构建文库，针对不同的研究物种采取有效的方法去除rRNA，保证数据质量。

产品优势：

•精确的数字化信号，GX的检测通量，广泛的检测范围

•富涵7大功能注释数据库，全面精确描述基因功能

•建立差异表达分析，有效挖掘功能基因

•专业的定制化信息分析服务

技术路线：

分析内容：

参考基因组比对；

新转录本预测；

测序质量评估；

UTR分析 基因表达水平分析；

反义转录本预测；

差异基因表达水平分析（2个以上样本）

sRNA分析（链特异性转录组）；

差异基因GO/KEGG富集分析；

SNP和InDel分析；

差异基因蛋白互作网络分析；

RNA-seq整体质量评估；

可视化结果展示 （利用ipath2.0对代谢途径进行可视化分析。）

样品要求：

1.样品类型：总RNA；

2.样品浓度：≥250 ng/ul；

3.样品总量：>10ug（原核生物）

4.样品纯度： OD260/280为1.8~2.2，OD260/230≥1.0，260nm处有正常峰值。

5.RNA完整性： 电泳检测28S/18S≥1.5。（距送样日最近的电泳结果）