产品简介:
长链非编码RNA(LncRNA)是一类长度大于200nt且不编码蛋白质的RNA,通常伴随着mRNA协同转录,广泛存在于各种生物体内,在表观遗传、转录及转录后等水平调控基因表达,在生命活动中具有重要作用。
LncRNA测序是研究已有参考基因组物种的特定组织或细胞在某个特定时期转录出的所有LncRNA和mRNA。
应用领域:
• 新lncRNA找寻与预测
• 疾病研究
• 调控网络研究
产品优势:
分析内容全面:不限于对已知lncRNA的研究分析,并设置严格的筛选条件预测新的lncRNA;
数据信息量大:可一次性获得样本中几乎所有的lncRNA信息,有利于提高后续分析结果的准确性和全面性;
测序物种多元:对包括人类、动植物在内的许多物种的lncRNA进行鉴定和分析;
关联全面分析:得到mRNA数据,可开展lncRNA与mRNA的关联分析,深入分析lncRNA调控网络。
技术路线:
分析内容:
mRNA分析 | SNP、Indel鉴定、可变剪切鉴定、基因结构优化、预测新转录本、差异mRNA聚类、差异表达分析、差异基因功能注释通路富集分析等 |
lncRNA分析 | 差异lncRNA筛选、lncRNA注释、lncRNA保守性分析 、lncRNA定量及差异表达分析、lncRNA家族分析、靶基因预测、miRNA前体预测分析等 |
lncRNA-mRNA 关联分析 | 表达水平分析、差异表达分析、共表达网络构建分析、Cis/Trans作用分析等 |
样品要求:
1. 样品类型:总RNA;
2. 样品浓度:≥200 ng/ul;
3. 样品总量:≥10ug;
4. 样品纯度:OD260/280为1.8~2.2,OD260/230≥1.0,260nm处有正常峰值;无基因组DNA污染;
5. RNA完整性:电泳检测28S/18S≥1.5。(据送样日最近的电泳结果)