全长转录组测序

产品简介：

全长转录组研究是理解生物机体功能的一个重要途径。传统二代转录组测序无法直接获得单个RNA分子由5ˊ到3ˊ的全部序列。基于PacBio三代测序平台的转录组研究，无需片段打断，直接读取反转录的全长cDNA，能够有效获取高质量的单个RNA分子的全部序列。无需进行转录本的组装，即可准确辨别二代测序无法识别的完整的、准确的可变剪接、转录起始位点，能够有效的获取高质量的单个mRNA分子的序列信息。

产品优势：

无需组装，直接测序获得全长mRNA和lncRNA转录本；

可准确识别可变剪接形式，检测新基因和新的基因亚型；

无参考基因组情况下，解析物种特有基因或基因家族；

提高无参转录组研究的定量准确性。

测序实验流程图：

 技术路线：

分析内容：

测序Reads质量质控（QV）;

测序Reads聚类;

转录本全长评估;

基因结构优化;

新转录本的预测;

转录本功能注释;

基因融合分析;

可变剪接鉴定;

等位基因分析（基于同一样本的二代数据）;

非编码RNA及其靶基因预测;

SSR分析;

SNP分析（基于同一样本的二代数据）;

CDS预测;

样品要求： 

1.  样品类型：总RNA；

2.  样品浓度：≥300 ng/ul；

3.  样品总量：≥1ug；

4.  样品纯度：OD260/280为1.8~2.2，OD260/230≥1.0，260nm处有正常峰值；无基因组DNA污染；

5.  RNA完整性：电泳检测28S/18S≥1.5。（据送样日最近的电泳结果）