测序类服务：全长鸟枪法测序实验服务

实验技术简介：鸟枪法（Shotgun）测序又称随机测序战略，主要针对大片段 的全长测序。此策略是将基因组DNA 用机械方法随机打断成小片段，并连接入合适的载体，构建亚克隆文库，从中随机挑取克隆测序，再通过生物信息学方法对测得的序列进行拼接组装以获得大片段 DNA的序列。Shotgun策略已广泛应用于包括基因组、叶绿体、线粒体、野生质粒、噬菌体、病毒以及Fosmid/Cosmid/BAC克隆等的全长 测序。

实验操作流程：
1、建立高度随机、插入片段大小为2kb左右的基因组文库。克隆数要达到一定数量，即经末端测序的克隆片段的碱基总数应达到基因组5倍以上。
2、GX、大规模的末端测序。对文库中每一个克隆，进行两端测序，TIGR在完成流感嗜血杆菌的基因组时，使用了14台测序仪，用三个月时间完成了必需的28,463个测序反应，测序总长度达6倍基因组。
3、序列集合。TIGR发展了新的软件，修改了序列集合规则以ZD限度地排除错误的连锁匹配。
4、填补缺口。有两种待填补的缺口，一是没有相应模板DNA的物理缺口，二是有模板DNA但未测序的序列缺口。他们建立了插入片段为15-20kb的λ文库以备缺口填补。

实验注意事项：
客户提供：
1、叶绿体/线粒体/病毒/噬菌体：全长测序需提供浓度≥50 ng/μl，总量≥5 μg，经纯化过的DNA样品；
2、质粒：提供OD260/280值介于1.80～2.00之间，浓度≥50 ng/μl，总量≥20 μg的DNA，并确保DNA没有发生降解；
3、Fosmid/Cosmid/BAC克隆请提供甘油菌或穿刺菌：请注明其培养基、抗生素抗性、载体名称及是否需要诱导等信息。
交付标准：
完整项目报告（材料、试剂、仪器、方法、数据分析、实验结果）

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