RNA干扰 (RNA interference, RNAi)技术,是将与内源mRNA 编码区同源的小片段(19 -23bp)外源双链 RNA(siRNA)导入细胞中,引发细胞中相应mRNA GX特异性降解,从而导致特定基因表达沉默(knock down)的一种实验技术。吉赛生物针对circRNA的接头序列设计siRNA序列特异性敲低目的circRNA的表达。对于每条选定的siRNA靶序列,设计 siRNA 正义链和反义链,以 loop(6nt or 7nt) 相连,形成稳定的发卡RNA,即为 shRNA(short hairpin RNA),可构建shRNA质粒直接转染或通过病毒包装后转染细胞,并对转染细胞进行阳性鉴定和转代细胞株的培养,ZZ实现对特定circRNA特异性敲低的作用。
案例
针对circRNA circPAIP2进行siRNA敲低实验示意图
我们的优势
l shRNA载体转染效率高、操作简单、RNA沉默效果易于检测
l 设计circRNA divergent primers检测敲低circRNA的效率
l 特异性敲低circRNA的表达,不影响亲本线性基因的表达
实验名称 | 项目内容 | 周期(工作日) | 备注 |
circRNA siRNA筛选 | siRNA设计和合成 | 15 | 含1条阴性对照及3条siRNA |
细胞转染(客户提供细胞) |
PCR干扰效率验证 |
circRNA shRNA载体构建 | 载体构建 | 20 | 1.一条shRNA质粒,2.对照shRNA质粒,3.干扰验证报告 |
细胞转染(客户提供细胞) |
PCR干扰效率验证 |
病毒包装 | 慢病毒包装 | 20 | 过表达病毒液108 TU/ml,1ml 赠送对照病毒液 |
稳定细胞株构建检测 | circRNA稳定细胞株筛选 | 20 | 病毒感染后筛选,检测过表达效率 |