表观组测序服务
采用Hiseq2500高通量测序仪，准确GX产出基因组数据
随着测序技术的不断发展，表观基因组学将成为遗传学未来的研究热点之一。 目前，惠研生物科技（BioGenius）可以提供的表观组学服务包括全基因组Bisulfite甲基化测序、RRBS、MeDIP-Seq和ChIP-seq等多种服务产品。
测序技术
表观组测序-甲基化测序
表 观遗传学是指在基因组DNA序列没有改变的情况下，基因的表达调控和性状发生了可遗传的变化，主要包括脱氧核糖核酸的甲基化和组蛋白修饰两类。以新一代高 通量测序平台为基础，结合表观遗传学研究方法，可以在全基因组水平进行基因调控机制研究，即表观基因组学研究。随着测序技术的不断发展，表观基因组学将成 为遗传学未来的研究热点之一。 目前，惠研生物科技（BioGenius）可以提供的表观组学服务包括全基因组Bisulfite甲基化测序、RRBS、 MeDIP-Seq和ChIP-seq等多种服务产品。
研究应用
基因组DNA甲基化修饰
组蛋白甲基化修饰
组蛋白乙酰化修饰
组蛋白磷酸化修饰
核小体定位与修饰关联调控
表观遗传学研究方法
全基因组Bisulfite甲基化测序
RRBS测序
MeDIP-Seq测序
ChIP-seq测序
我们的优势
拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台，实验周期短，质量可靠。
拥有Illumina HiSeq 2500、MiSeq等多种高通量测序平台。
技术人员经验丰富，可以根据合作伙伴要求提供实验方案、解决实验问题、分析实验结果。
拥有专业的生物信息团队和超算服务器，可为合作伙伴提供全面生物信息分析服务与技术支持。
原理介绍
表观遗传机制介绍
DNA中胞嘧啶C可以被甲基化，组蛋白中的 赖氨酸(lysine)和精氨酸(arginine)残疾可以被修饰，包括甲基化，乙酰化，磷酸化和泛素化修饰。组蛋白修饰中涉及到的乙酰化，甲基化和磷酸化修饰是通过一种称之为Writer的酶将其写入 组蛋白，并通过“erasers”酶将修饰擦除。其他称为“Reads”蛋白可以识别特定的修饰模式，通过与修饰位点结合并招募其他蛋白质共同调控基因表 达活性。体内不同细胞和器官或不同生理应激环境将产生不同的修饰模式。目前，表观组差异在疾病研究中已经积累大量证据，因此表观组学称为日益活跃和重要的 前言医学研究领域。
测序方法比较
不同NGS测序技术方法性能比较
关于如何选择NGS高通量测序平台中的甲基化技术或DNA芯片技术实现DNA甲基化组研究，需要参考以下方面并作出适合课题方向和满足预算要求的选择。
关于基因组DNA甲基化覆盖区域的程度对比，MeDIP 和 MethylCap 覆 盖到比较广泛的基因组区域，RRBS与Infinium芯片方法是集中于CpG islands 和 promoter regions 启动子区域。选 择哪个平台方法取决于研究的对象特点，是选择CpG-rich区域还是全部，还是GpG-poor区域。另外，需要考虑的还有测序的数据量，样本数目等各 个因素。 从覆盖度角度考虑，MethylCap 覆盖基因组程度大于MeDIP ，RRBS和 Infinium主要富集探测 CpG-rich区域，因此RRBS对全基因组范围的CpG覆盖度较低（因为基因组很多是CpG- poor），Infinium是对特定局限性区域的研究（芯片方法）；而MeDIP 和 MethylCap 可以覆盖到更广的基因组区域，包括CpG- rich,和CpG-poor区域，因为整个基因组绝大多数是CpG-poor区域且处于甲基化状态的，只有小部分是处于非甲基化状态和CpG-rich 区（也就是所谓的CpG islands），MeDIP 和 MethylCap就因此主要富集在低CpG密度区域，和一小部分的甲基化的 CpG islands区域。4种方法对CpG-rich区域探测性一致。 从准确度角度考虑，RRBS和Infinium表现略好于富集方法：MeDIP 和 MethylCap，RRBS和Infinium不需对CpG偏差在统计学上进行校正； 对于DMR（差异甲基化区域）分析的考虑，RRBS与 MeDIP 和 MethylCap 方法识别的DMR具有很高一致性。RRBS识别的DMR多于MeDIP，但略少于MethylCap；而 Infinium 方法只能发现测序方法所获得的DMR的20%的结果数目。 测序方法比较适合探测重复序列区域（可能也与转座子等临床病理研究相关的因素，需要考虑），而芯片不适合。 富集的方法（MeDIP 和 MethylCap ）达到基因组范围内单位CpG覆盖 的成本ZD；而RRBS达到CpGislands内单位CpG覆盖的成本ZD；（7）可以采用将MeDIP-seq 或 MBD-seq方法与MRE- seq 或RRBS技术相互组合的方式以提高基因组的探测覆盖度。缺点是这样就会增加1倍研发预算。
Figure: DNA甲基化研究技术特点与潜在偏好性比较图
Figure: DNA甲基化研究技术原理比较图
Figure: DNA甲基化研究技术适用样本规模与可获取分析的CpG数目对比图
更多详情： http://www.biogenius.cn/htm/products/epigenomicsseq/
Big Data , Big Idea !
惠研生物，提供领先的生物大数据解决方案！
- 全基因组测序/外显子组, 转录组等项目共计 完成近万个样本的测序与分析服务
- 累计协助客户发表权威SCI论文总IF超过 160分
- 512核心CPU，1T内存 满足大规模并行的，敏捷的数据分析服务;
- 1PB 数据磁盘阵列保证企业级 测序分析结果存储的安全稳定
官方网站：www.biogenius.cn
咨询热线：400-016-9606 / 180-1908-2932
官方微信： 微信公众平台搜索 “惠研生物”
官方QQ： 1744353207
咨询邮箱： service@biogenius.cn
沪公网安备 31011502008050号
